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Non sono un tecnico, ma dalle tue parole capisco che non è facile mettere in digitale qualcosa che il nostro cervello fa in automatico. Cionondimeno, questa caratteristica sarebbe veramente utile e vale la pena di perderci un pò di tempo.
Forse semplifico eccessivamente ma basterebbe che venisse segnalato ( alert) quando all'interno di un intervallo si trova un numero di minimum stay superiore al numero delle notti disponibili.
Esempio: |P|P|2|2|7|2|2|2|P|P|P| dove P sta per prenotato, il 7 è all'interno di 6 notti, quindi viene segnalato. Lo stesso dicasi per i casi più comuni: |P|P|3|P|P|P| quando rimane il minimum stay "dimenticato" di 3 notti è all'interno di 1 notte libera.